Trong tương lai gần, hiện tượng gia tăng mực nước biển một cách đột ngột và không thể giải thích đã làm cho một phần của nền văn minh con người bị chìm sâu dưới nước. Ikaruga Natsuki, một cậu bé đã mất mẹ và chân trong một tai nạn mấy năm trước đây, trở về nhà quê cũ của mình sau những năm sống khó khăn ở thành phố lớn với niềm tin đầy thất vọng khi thấy nhà cũ của mình đã bị nửa chìm trong biển. Không có gia đình, tất cả những gì cậu có chỉ là chiếc tàu và tàu ngầm mà bà nội của cậu để lại, cùng với các khoản nợ.
Hy vọng duy nhất để khôi phục giấc mơ về tương lai mà cậu đã mất là một cơ hội được giới thiệu bởi Catherine - một người thu nợ đáng ngờ. Họ lên đường tìm kiếm những tàn tích đắm tàu của phòng thí nghiệm của bà cậu để tìm kho báu mà đồn đại bà đã để lại. Nhưng điều họ tìm thấy không phải là của cải hoặc viên ngọc quý; đó là một cô gái lạ kỳ đang nằm ngủ trong một quan tài ở đáy biển. Atri.
Atri là một người máy, nhưng ngoại hình và vô số cảm xúc của cô ấy có thể đánh lừa bất cứ ai nghĩ rằng cô ấy là một con người đang sống, thở. Để biết ơn vì đã được cứu, cô ấy tuyên bố với Natsuki.
"Em muốn hoàn thành mệnh lệnh cuối cùng của chủ nhân. Cho đến khi anh chết, em sẽ là chân của anh!
Trong một thị trấn nhỏ đang dần bị bao bọc bởi đại dương, một mùa hè khó quên sắp bắt đầu đối với cậu bé và cô gái người máy bí ẩn này ...